东江纵队司令部位于广东深圳市龙岗区葵涌街道土洋村，该建筑建于1912年，为中西合璧风格的意大利天主教堂，由主楼、礼拜堂和附属用房等三部分组成，中间有走廊相通，建筑总面积400平方米。1942年春，神父撤离土洋村。根据战争形势的发展和有利于开展敌后游击战争的需要，中国共产党领导的广东人民抗日游击总队的指挥部由龙华迁到葵涌土洋村该建筑内。

1943年12月2日，遵照党中央的指示，广东人民抗日游击队东江纵队正式公开宣布成立，司令员曾生，政治委员尹林平，副司令员兼参谋长王作尧，政治部主任杨康华。该建筑成为东江纵队司令部所在地，主楼为曾生、尹林平、王作尧等领导人工作和居住的场所，礼拜堂则作为会议室和作战室，附属用房改为工作人员的工作用房。楼房后面的小平地，是小型练兵场。练兵场后侧建有一座琉璃正檐八角亭，为解放后人民政府所建的“东江纵队纪念亭”。

1944年8月，中共广东省临时委员会和东江军政委员会在该建筑内召开联席会议，讨论中央关于东江纵队开展敌后游击战争的指示，分析当时广东地区的斗争形势，作出6项重要决定：第一，在全省继续放手发动和武装群众，开展敌后游击战争，建立根据地与发展游击区；第二，战略方针是独立自主的游击战，主要打击方向是日伪军，同时坚持自卫的反摩擦斗争；第三，东江纵队建立支队编制，加强部队的思想、军事教育及各项制度建设；第四，普遍建立抗日自卫队与常备队；第五，恢复和加强地方党的组织活动；第六，成立珠江三角洲指挥部和中区指挥部，扩大东江军政委员会人数。土洋会议对加强广东党组织的建设和军队建设，全面发展广东的抗日武装斗争，具有重大的战略意义。1945年春，东纵司令部由土洋村迁到博罗县罗浮山。

解放后，该旧址一度成为土洋小学校址。1984年9月，被深圳市人民政府公布为市级文物保护单位。1995年公布为深圳爱国主义教育基地，1997年3月，市、区、镇拨专款修复东纵司令部旧址，并在该处设立东纵史迹展览馆。1998年5月4日旧址正式对外开放。基本陈列分为《东江纵队史迹展》和复原陈列两部分。史迹展通过119件实物以及大量的照片、文献资料，展示了东江纵队“南域先锋、海外蜚声、艰苦风范、永继永存”的革命精神和战斗历程。复原陈列通过对曾生司令员当时工作和生活用过的部分实物的复原，再现曾生同志在艰苦的条件下，率东纵不屈不挠、英勇抗日而成为“为民先锋”的史实。2002年7月，东纵司令部旧址被广东省人民政府公布为省级文物保护单位。